1983 yılında Samsun’un Çarşamba ilçesinde dünyaya geldi. İlk, orta ve lise eğitimini Samsun’da tamamlayan Emre GÜNDOĞDU Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesinde başladığı lisans eğitimini 2006 yılında tamamlayarak “Tıp Doktoru” ünvanını aldı. Aynı yıl tıpta uzmanlık sınavını başarıyla geçerek Genel Cerrahi asistanlık eğitimine Ankara Numune Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde asistanlık eğitimine başladı.